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PsychoFish 可用于成年斑马鱼(3 月龄)或幼年斑马鱼(1-2 月龄)群体凝聚力及个体运动能力及趋势两方面的研究。
其包含以下3 个组成部分:
1. 机械单元
2. 图像采集系统
3. 数据显示、存储、分析硬件/软件
数据处理及分析
(1)斑马鱼群体凝聚力分析
观测群里凝聚力时,需要考虑多方面的因素,包括空间需求、水深、个体数目或群体规模等,PsychoFish 建议在深度为2cm 的水中进行测试。测试时,位于机械单元水平杆上的前后摄像头可记录每一斑马鱼个体的运动情况,拍摄成一系列的图片,然后通过KOMI 程序进行分析即可。图片拍摄、鱼池尺寸和数目等参数可通过软件面板进行设置。
视频采集过程中,软件使用图解和数值计算的方式自动对采集的图像进行分析,得到各种评价斑马鱼群行为学的数据。软件识别图像中的斑马鱼个体并用白色十字标记,所有呈现于屏幕的斑马鱼个体可形成一区域多边形,多边形面积、斑马鱼个体间距等数据即可用于反映鱼群群体凝聚力大小。
视频采集过程中,软件使用图解和数值计算的方式自动对采集的图像进行分析,得到各种评价斑马鱼群行为学的数据。软件识别图像中的斑马鱼个体并用彩色十字标记,被标记的斑马鱼个体以及其运动轨迹会呈现于分析窗口。同时,所有斑马鱼运动速度及路程也会被计算并输出至Excel 表格中。
参考文献:
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